根据《甘肃林区法院、检察院司法改革方案》，祁连山院单位名称由原“迭部林区人民检察院”更名为“祁连山林区人民检察院”，管辖范围由原来迭部林区扩大为甘肃祁连山、甘肃盐池湾、甘肃民勤连古城、敦煌西湖、安南坝野骆驼五个国家级自然保护区。调整后辖区横跨4市13县，总面积546万公顷，人口约6万人。辖区点多、线长、面广，东西长约1200公里。辖区面积由原来的25万公顷扩大到546万公顷。涉及共有42个自然保护站，68个乡镇。

祁连山林区人民检察院位于张掖市甘州区长沙门路257号诚信大厦7楼，使用面积1364.04平方米，设有院会议室、视频会议室、党组活动室、档案室、机房、机要室、办案工作区等。

院内设置两部一室，分别为第一检察部、第二检察部、综合行政办公室。在院干警21人，其中政法编制16人，实有在编15人，空编1人，其中，副处级1人，正科级7人，副科级4人，科员3人，聘用制书记员6人。领导班子共4人：检察长1人、副检察长2人，党组成员1人。“三类人员”13人：员额检察官6人（含院领导3人），检察辅助人员4人（检察官助理1人，书记员3人），司法行政人员3人。法警2人（1人为党组成员）.